Microbial source tracking and antimicrobial resistance in one river system of a rural community in Bahia, Brazil / Rastreamento de fontes microbianas e resistência antimicrobiana em um sistema fluvial de uma comunidade rural da Bahia, Brasil

Use of antibiotics inevitably leads to antimicrobial resistance. Selection for resistance occurs primarily within the gut of humans and animals as well as in the environment through natural resistance and residual antibiotics in streams and soil. We evaluated antimicrobial resistance in Gram negative bacteria from a river system in a rural community in Bahia, Brazil. Water was collected from the Jiquiriçá and Brejões rivers and the piped water supply. Additionally, stools were collected from a random sample of residents, cows, pigs and horses near the river. The samples were screened for bacteria resistant to ciprofloxacin, cefotaxime, and meropenem and identified biochemically at the genus and species levels. Microbial source tracking demonstrated that ruminant and human fecal contamination increased as the rivers neared the village center and decreased after the last residence. Antibiotic bacteria were identified from all samples (n = 32). No bacteria were resistant to carbapenems, but the majority of the enterobacteria were resistant to ciprofloxacin, even though this class of antibiotics is not commonly used in food animals in this region. Considering these facts, together with the pattern of human fecal contamination, a human source was considered most likely for these resistant isolates.

O uso de antibióticos inevitavelmente leva à resistência antimicrobiana. A seleção para resistência antimicrobiana ocorre principalmente no intestino de seres humanos e animais, bem como no meio ambiente, através da resistência natural e resíduos de antibióticos nos esgotos e no solo. Avaliamos a resistência antimicrobiana em bactérias Gram-negativas de um sistema fluvial em uma comunidade rural da Bahia, Brasil. A água foi coletada nos rios Jiquiriçá e Brejões e no abastecimento de água encanada. Além disso, foram coletadas amostras randomizadas de fezes de moradores, vacas, porcos e cavalos próximos ao rio. As amostras foram triadas para bactérias resistentes à ciprofloxacina, cefotaxima e meropenem e identificadas bioquimicamente nos níveis de gênero e espécie. O rastreamento de fontes microbianas demonstrou que a contaminação fecal de ruminantes e humanos aumentou à medida que os rios se aproximavam do centro da vila e diminuía após a última residência. Bactérias resistentes a antibióticos foram identificadas em todas as amostras (n = 32). Nenhuma bactéria demonstrou ser resistente aos carbapenêmicos testados, contudo, foi encontrado enterobactérias resistentes à ciprofloxacina, ainda que essa classe de antibióticos não seja comumente usada na medicina veterinária dos animais dessa região. Considerando esses fatos, juntamente com o padrão de contaminação fecal avaliado, a fonte de contaminação humana foi considerada a mais provável na interação desses isolados resistentes.

Use of MALDI-TOF for identification and surveillance of gramnegative bacteria in captive wild psittacines / Uso do MALDI-TOF para identificação e monitoramento de bactérias Gram negativas em psitacídeos cativos

Microbiological studies of the sanitary and health status of psittacine birds that will be reintroduced is important in evaluating whether these animals act as carriers of pathogenic agents to other animals and humans. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is a faster and more accurate method to identify bacteria than conventional microbiology methods. The aim of this study was to evaluate the health status of psittacines housed in captivity, by assessment of Gram-negative bacteria from fecal microbiota through MALDI- TOF MS identification. The results indicate high frequency of Gram-negative bacteria in feces (96.5%), especially from the Enterobacteriaceae family (88.7%). The most prevalent bacteria were Escherichia coli (39.0%), Proteus vulgaris (12.2%), Klebsiella spp. (12.1%) and Raoultella ornithinolytica (8.7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. and Escherichia hermannii were isolated with lower frequency. . All these agents are potentially pathogenic for parrots and can cause systemic infections in other animals and humans. These findings reinforce that MALDI- TOF MS proved to be a rapid and accurate method of identification of the microorganism and evaluation of the health status of psittacines, providing relevant data to assist decision-making regarding the sanitary protocols in wildlife centers, and possible future reintroduction of wild birds.

Estudos microbiológicos da sanidade de psitacídeos que serão reintroduzidos são importantes para avaliar se esses animais atuam como portadores de agentes patogênicos para outros animais e humanos. A espectrometria de massa por ionização/dessorção de matriz assistida por laser/tempo de vôo (MALDI-TOF MS) é um método mais rápido e preciso para identificar bactérias na comparação com métodos convencionais de microbiologia. O objetivo deste estudo foi avaliar o estado de saúde de psitacídeos cativos, identificando bactérias Gram-negativas da microbiota fecal por MALDI -TOF MS. Os resultados indicaram alta frequência de bactérias Gram-negativas nas fezes (96,5%), principalmente da família Enterobacteriaceae (88,7%). As mais prevalentes foram Escherichia coli (39,0%), Proteus vulgaris (12,2%), Klebsiella spp. (12,1%) e Raoultella ornithinolytica (8,7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. e Escherichia hermannii foram isolados com menor frequência. Todos esses agentes são potencialmente patogênicos para os papagaios e podem causar infecções sistêmicas em outros animais e seres humanos. Esses achados reforçam que o MALDI- TOF MS é um método rápido e preciso de identificação do microrganismo e avaliação do estado de saúde dos psitacídeos, fornecendo dados relevantes para auxiliar na tomada de decisões sobre os protocolos sanitários em centros de triagem de animais selvagens e sobre a possibilidade de reintrodução futura.

Bacterial resistance in bats from the Phyllostomidae family and its relationship with unique health / Resistência bacteriana em morcegos da família Phyllostomidae e sua relação com a saúde única

The Phyllostomidae family is important among the bats found in Brazil, with several species and diverse eating habits, and is the only one to have frugivorous representatives. These bats can be found in urban and in wild life environments in search for the best reproductive and feeding conditions. The versatility of environments can be associated with the incidence and/or distribution of some diseases through pathogenic agents. The present paper has the purpose to identify the oral and perianal microbiota and to detect the bacterial resistance of frugivorous bats captured near communities inhabited by humans in the northwestern region of the state of Paraná. A total of 68 bats were captured, belonging to four species of the Phyllostomidae family, namely Artibeus lituratus, Artibeus planirostris, Carollia perspicillata and Sturnira lillium, originated from forest fragments in the micro region of Umuarama, state of Paraná. A total of 64 isolates from oral bacteria and 39 from perianal region were submitted to identification. They were later submitted to a susceptibility test to 22 human and veterinary antimicrobials. The most prevalent bacteria were Escherichia coli 33.3% in the oral region, and 35.90% in the perianal region, Enterobacter aerogenes 12.7% and 5.13%, Enterobacter agglomerans 7.9% and 10.25%, and Serratia liquefaciens 9.5% and 5.13% in the oral and perianal region respectively. All bat species studied had resistant strains, with a few of them presenting multi-resistance to antimicrobials. The species with the highest multi-resistance index to antimicrobials was Carollia perspicillata, with three strains of the oral region resistant to 15 antimicrobials; it also presented two strains in the perianal region, which were resistant to 13 and 10 antimicrobials respectively. Based on the results found, it is possible to conclude that the oral and perianal microbiota of bats is composed of several enterobacterial species resistant to one or several antimicrobials used in human and veterinarian medicine. This is an issue and a future warning for unique health, since high percentages of resistance were found against antimicrobials broadly used, such as ampicillin, amoxicillin and amoxicillin+clavulonate.(AU)

A família Phyllostomidae se destaca entre as famílias de morcegos encontrados no Brasil, com diversificadas espécies e hábitos alimentares, sendo a única a apresentar representantes frugívoros, podendo ser encontrada tanto em meio urbano, como de vida livre, em busca de melhores condições reprodutivas e alimentares. Essa versatilidade de ambientes pode estar associada à incidência e/ou distribuição de determinadas doenças por agentes patogênicos. O presente trabalho objetivou identificar a microbiota oral e perianal e detectar a resistência bacteriana em morcegos frugívoros capturados próximos às comunidades habitadas pelo homem na região noroeste do estado do Paraná. Foram capturados 68 morcegos, de quatro espécies da família Phyllostomidae, são eles Artibeus lituratus, Artibeus planirostris, Carollia perspicillata e Sturnira lillium, oriundos de fragmentos de Mata da microrregião de Umuarama, estado do Paraná. Um total de 64 isolados de bactérias da região oral e 39 da região perianal foram submetidos, identificação e posteriormente teste de susceptibilidade a 22 antimicrobianos de uso humano e veterinário. As bactérias mais prevalentes foram Escherichia coli 33,3% na região da boca e 35,90% na região perianal, Enterobacter aerogenes 12,7% e 5,13%, Enterobacter agglomerans 7,9% e 10,25% e Serratia liquefaciens 9,5% e 5,13% na região da boca e perianal, respectivamente. Todas as espécies de morcegos estudadas apresentaram cepas que foram resistentes, e algumas multirresistência aos antimicrobianos. A espécie que apresentou maior índice de multirresistência aos antimicrobianos foi Carollia perspicillata, com três cepas na região oral resistente a 15 antimicrobianos, e duas na perianal, com resistência a 13 e 10 antimicrobianos respectivamente. Baseados nos resultados encontrados, é possível concluir que a microbiota oral e perianal de morcegos, é composta por diversas espécies de enterobactérias, resistentes a um, ou vários antimicrobianos utilizados na medicina humana e veterinária, tornando-se um problema, e um alerta futuro para a saúde única, uma vez que foram encontrados elevados percentuais de resistência contra antimicrobianos utilizados em larga escala tais como ampicilina, amoxicilina e amoxicilina+clavulonato.(AU)

Anaplasma phagocytophilum direct detection and exposure evidence in equines from two breeding farms from Minas Gerais State, Brazil / Detecção direta e evidência da exposição a Anaplasma phagocytophilum em equinos de dois haras em Minas Gerais, Brasil

Equine granulocytic anaplasmosis is caused by Anaplasma phagocytophilum, a gram negative, obligatory intracellular bacterium, member of Anaplasmataceae family, included in the Rickettsiales order. Little is known about the disease, transmission dynamics, genetic diversity and prevalence in Minas Gerais state, Brazil. This work aimed to do a serosurvey using indirect immunofluorescent assay (IFA) test and evaluation of buffy coat smears, and nested polymerase chain reaction (PCR) as diagnostic methods, to determine the disease situation in horses from two manga-larga marchador breeding farms located in the municipalities of Ataléia e São Vicente de Minas, in Minas Gerais state. It was found that 76% (131/172) of the animals were considered reactive for IFA test, and the total of 12.8% was positive at buffy coat smears analysis. At PCR analysis, it was found 1.94% of the samples positive to the infection. Those samples were sequenced and showed 96% of similarity to A. phagocytophilum from a Ixodes ricinus tick. There is a high frequency of animals with the evidence of contact to A. phagocytophilum on the two evaluated properties in this study, which was proved by positiveness in PCR analysis. New researches must be carried out to better understand the epidemiologic and clinical dynamic of the disease in the state of Minas Gerais.(AU)

A anaplasmose granulocítica equina é causada por uma bactéria gram-negativa, intracelular obrigatória, membro da família Anaplasmataceae, incluída na ordem Rickettsiales e denominada de Anaplasma phagocytophilum. Pouco se sabe sobre a doença, sua dinâmica de transmissão, diversidade genética e prevalência em Minas Gerais, Brasil. Este trabalho teve por objetivo realizar o levantamento sorológico utilizando a reação de imunofluorescência indireta, avaliação direta de capa leucocitária e nested reação em cadeia da polimerase (PCR) como métodos diagnósticos, a fim de avaliar a situação da doença em dois haras de criação de cavalos manga-larga marchador localizados nas cidades de Ataléia e São Vicente de Minas, no estado de Minas Gerais. Foi encontrada prevalência de 76% (131/172) de animais reativos para a reação de imunofluorescência indireta, quando todos os animais das duas propriedades e das duas coletas foram agrupados, e 12,8% dos animais foram positivos na avaliação da capa leucocitária. A reação de imunofluorescência indireta detectou 1,94% das amostras como positivas para o agente. Essas amostras foram submetidas ao sequenciamento de nucleotídeos, e foi observada similaridade de 96% com A. phagocytophilum proveniente de carrapatos Ixodes ricinus. Existe alta prevalência de animais positivos para a infecção por A. phagocytophilum, o que foi provado pela positividade dos animais à PCR. Novas pesquisas devem ser conduzidas a fim de entender a dinâmica epidemiológica e clínica da doença no estado de Minas Gerais.(AU)

Identificación y sensibilidad antimicrobiana de bacterias gramnegativas causantes de neumonía en pacientes VIH/sida / Identification and antimicrobial sensitivity of gramnegative bacteria causing pneumonia in HIV/AIDS patients

Las bacterias gramnegativas se consideran como causa frecuente de neumonía en pacientes VIH/sida. La emergente y elevada proporción de microorganismos resistentes obliga a utilizar el antibiograma como un método que definirá la terapéutica de estos pacientes. Objetivos: identificar las bacterias gramnegativas que causan neumonía en pacientes VIH/sida y determinar la sensibilidad antimicrobiana de los microorganismos aislados. Métodos: se realizó un estudio descriptivo prospectivo en el Instituto Pedro Kourí de 85 pacientes con VIH/sida y diagnóstico presuntivo de neumonía bacteriana por criterios clínicos y radiológicos. Se recogieron muestras de esputo y sangre para cultivo. Las bacterias aisladas y la sensibilidad antimicrobiana se determinaron por el sistema semiautomatizado miniApi (bioMérieux). Resultados: se aislaron 74 bacterias potencialmente patógenas de las que 32 (43,2 porciento) se clasificaron como gramnegativas. Predominaron Klebsiella pneumoniae (11 cepas: 34,3 porciento), Pseudomonas spp. (8 cepas: 25 porciento) y Escherichia coli (4 cepas: 12,5 porciento). Escherichia coli mostró el mayor porcentaje de resistencia y el 75 porciento de las cepas fue sensible frente a la amikacina. No se encontró resistencia al meropenem y más del 50 porciento de las enterobacterias identificadas con excepción de E.coli fueron sensibles a las cefalosporinas de tercera generación, ciprofloxacina, amikacina y cotrimoxazol. Pseudomonas spp. presentó resistencia al cotrimoxazol (87 porciento) y ticarcilina (75 porciento). Conclusiones: las bacterias gramnegativas causan en un porcentaje no despreciable neumonía en pacientes con VIH/sida. Aunque persisten cepas resistentes frente a diversos antimicrobianos, las cefalosporinas, quinolonas y los carbapenémicos muestran una adecuada actividad frente a estas bacterias

Gramnegative bacteria are considered to be a common cause of pneumonia in HIV/AIDS patients. The emergence of a large number of resistant microorganisms has made it necessary to use antibiograms to decide what treatment will be applied to these patients. Objectives: identify gramnegative bacteria causing pneumonia in HIV/AIDS patients and determine the antimicrobial sensitivity of the microorganisms isolated. Methods: a prospective descriptive study of 85 patients with HIV/AIDS and presumed diagnosis of bacterial pneumonia was carried out at Pedro Kourí Institute applying clinical and radiological criteria. Sputum and blood samples were collected to be cultured. The bacteria isolated and their antimicrobial sensitivity were determined using the mini-Api (bioMÚrieux) semiautomated system. Results: seventy-four potentially pathogenic bacteria were isolated, of which 32 (43.2 percent) were classified as gramnegative. The prevailing ones were Klebsiella pneumoniae (11 strains: 34.3 percent), Pseudomonas spp. (8 strains: 25 percent) and Escherichia coli (4 strains: 12,5 percent). Escherichia coli exhibited the highest resistance percentage. 75 percent of the strains were sensitive to amikacin. No resistance was found to meropenem, and more than 50 percent of the enterobacteria identified, with the exception of E. coli, were sensitive to third-generation cephalosporins, ciprofloxacin, amikacin and cotrimoxazol. Pseudomonas spp. showed resistance to cotrimoxazol (87 percent) and ticarcillin (75 percent). Conclusions: gramnegative bacteria cause pneumonia in HIV/AIDS patients to a considerable extent. There continue to be strains which are resistant to various antimicrobial drugs. However, cephalosporins, quinolones and carbapenemics exhibit adequate activity against these bacteria

Changing trends of in vitro antimicrobial resistance patterns in blood isolates in a tertiary care hospital over a period of 4 years.

Context: Multidrug-resistant organisms continue to be a problem for clinicians worldwide. AIMS: To analyze the changing trend of antimicrobial susceptibility patterns in the blood isolates over a period of 4 years in our hospital. Settings and Design: This is a retrospective study done in tertiary care cardiac institute over a period of 4 years. Materials and Methods: We retrospectively analyzed blood culture positive isolates and studied the antimicrobial susceptibility patterns of microorganisms during the period starting from January 2007 to December 2010. Statistical Analysis Used: Statistical analysis was conducted using SPSS for windows version 13.0. Fisher exact test or chi-square test was applied for comparison of categorical variables. P values less than .05 were considered as statistically significant. Results: The rate of blood culture positivity was 3.72%. Gram-negative bacteria were more common than Gram-positive bacteria. There was a gradual increase in Gram-negative bacteria especially Klebsiella pneumoniae and Acinetobacter species. Klebsiella pneumoniae showed a significant increase of resistance to cefoperazone sulbactam (P = .023), piperacillin tazobactam (P < 0.001), imipenem (P < 0.001), and meropenem (P < 0.001) between the first (2007-2008) and second period (2009-2010) of study. The carbapenems resistance is on rise in Gram-negative bacteria including Enterobacteriaceae and non-fermenters. Conclusions: Our findings suggest that there is a definite increase in the multidrug resistant organisms. The data on the changing trends in antibiotic resistance, we believe is an important pillar in our efforts at improving infection control practices.

Diarrea del viajero: prevención y tratamiento / Traveler’s diarrhea: prevention and treatment

La diarrea del viajero (DV) afecta a 34 millones de personas que viajan a países en desarrollo todos los años. El destino representa el factor de riesgo más importante para el desarrollo de DV. Por mucho, los agentes etiológicos más frecuentes son bacterias patógenas (Escherichia coli enterotoxigénica, Escherichia coli enteroagregativa, Campylobacter, Salmonella). La reducción en la tasa de diarrea sería posible al evitar el consumo de alimentos y bebestibles contaminados. Una estrategia preventiva más eficaz consiste en administrar antibióticos todos los días durante viajes a áreas en que el riesgo de DV es alto. Rifaximina, antibiótico no absorbible recientemente aprobado, puede ser usado para el tratamiento de la DV en regiones donde la E. coli no invasora es el patógeno predominante. En áreas donde un organismo invasivo como el Campylobacter y Shigella son comunes, las fluoroquinolonas sigue siendo el medicamento escogido. La azitromicina es recomendada en áreas con Campylobacter resistente a las quinolonas y para el tratamiento de niños y mujeres embarazadas.

Traveler’s diarrhea (TD) affects 34 millions of people who travel to developing countries each year. Destination represents the single most important risk factor for developing TD. By far, the most frequent etiologic agents are bacterial pathogens (enterotoxigenic Escherichia coli, enteroaggregative E. coli, Campylobacter, Salmonella). Reduction in the rate of diarrhea maybe possible by avoiding contaminated foods and beverages. A more effective preventive strategy is daily administration of antibiotics during trips to areas where the risk of TD is high. Rifaximine, a recently approved non-absorbable antibiotic, can be used for the treatment of TD in regions where non invasive E. coli is the predominant pathogen. In areas where invasive organism such as Campylobacter and Shigella are common, fluoroquinolones remain the drug of choice. Azythromycin is recommended in areas with quinolone-resistant Campylobacter and for treatment of children and pregnant women.

Detection of antimicrobial-resistant gram-negative bacteria in hospital effluents and in the sewage treatment station of Goiânia, Brazil / Detecção de bactérias gram-negativas antimicrobiano-resistentes em efluentes de hospitais e na estação tratamento de esgoto de Goiânia, Brasil / Detección de bacterias gram negativas resistentes a antimicrobianos en efluentes hospitalarios y en la estación de tratamiento de aguas residuales de Goiânia, Brasil

The emergence of antimicrobial-resistant genes and the indiscriminate use of antibiotics contribute to the issemination of resistant pathogens in the environment. The objective of the present study was to isolate Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter spp., Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli from the sewage effluents of 10 hospitals located in Goiânia, Brazil, and from the sewage treatment station of the city, to determine their susceptibility profile and investigate their resistance mechanisms. The isolates from water samples were identified by biochemical tests and confirmed using API 20E (BioMerieux). Susceptibility profiling was performed by disc diffusion in accordance with the methodology established by the National Committee for Clinical Laboratory Standards. Extended-spectrum β-lactamase (ESBL) detection was carried out by the disk approximation method using phenotypic tests. Sixty-seven microorganisms were isolated and identified, including E. coli 10 (14,92%), K. pneumoniae 10 (14,92%), P. aeruginosa 3 (4,47%) and A. baumannii 1 (1,49%). Of the E. coli strains, 100% were resistant to aztreonam, 40% to ampicillin, 30% to piperacillin, 20% to ciprofloxacin and 10% to gentamicin. None of the bacterial strains produced ESBL or carbapenems. Of the P. aeruginosa strains, 100% were resistant to ampicillin-sulbactam, while 100% had intermediate resistance to gentamicin. Strains of K. pneumoniae were resistant to ampicillin (70%) and to piperacillin (20%); additionally, 50% showed intermediate resistance to piperacillin. Total resistance was not found in any of the isolates of A. baumannii, which showed intermediate resistance to aztreonam and ceftriaxone. Overall, resistance rates were low in the isolates of E. coli, P. aeruginosa, K. pneumoniae and A. baumannii.

La aparición de genes resistentes a antimicrobianos y la utilización indiscriminada de antibióticos contribuyen a la difusión de patógenos resistentes en el ambiente. El objetivo de este estudio fue aislar Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter spp., Klebsiella pneumoniae y Escherichia coli en efluentes de aguas residuales de 10 hospitales situados en Goiânia, Brasil, y de la estación de tratamiento de aguas residuales de la ciudad intentando determinar su perfil de susceptibilidad e investigar a sus mecanismos de resistencia. Los aislados de muestras de agua fueron identificados de promedio pruebas bioquímicas y confirmados utilizando API 20E (BioMerieux). El perfil de susceptibilidad fue realizado por difusión de disco de acuerdo con la metodología establecida por el National Committee for Clinical Laboratory Standards. La detección de beta-lactamasas de espectro extendido (ESBL) fue realizada de promedio el método de aproximación de discos utilizando pruebas fenotípicas. Sesenta y siete microorganismos fueron aislados e identificados, incluyendo E. coli 10 (14,92%), K. pneumoniae 10 (14,92%), P. aeruginosa 3 (4,47%) y A. baumannii 1 (1,49%). Las cepas de Escherichia Coli fueran 100% resistentes a aztreonam, 40% a ampicilina, 30% a piperacilina, 20% a ciprofloxacino y 10% a gentamicina. Ningunas de las cepas bacterianas produjeron ESBL o carbapenems. Las cepas de P. aeruginosa fueran 100% resistentes a ampicilina-sulbactam, mientras 100% presentaran una resistencia media a gentamicina. Las cepas de K. pneumoniae fueran resistentes a ampicilina (el 70%) y a piperacilina (el 20%); además, el 50% presentaran resistencia media a piperacilina. En términos globales, las tajas de resistencia fueran bajas en los aislados de Escherichia Coli, P. aeruginosa, K. pneumoniae y A. baumannii.

A emergência de genes antimicrobiano-resistentes e o uso indiscriminado de antibióticos contribuem para a disseminação de patógenos resistentes no ambiente. O objetivo deste estudo foi isolar Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter spp., Klebsiella neumoniae e Escherichia coli em efluentes de esgoto de 10 hospitais situados em Goiânia, Brasil, e da estação de tratamento de esgoto da cidade, para determinar seu perfil de susceptibilidade e investigar seus mecanismos de resistência. Os isolados das amostras de água foram identificados usando testes bioquímicos e confirmados com API 20E (BioMerieux). O perfil de susceptibilidade foi estabelecido pela difusão de disco de acordo com a metodologia estabelecida pelo National Committee for Clinical Laboratory Standards. A detecção de Beta-Lactamase de Espectro Estendido (ESBL) foi realizada pelo método de aproximação de discos usando testes fenotípicos. Sessenta e sete microorganismos foram isolados e identificados, incluindo E. coli 10 (14,92%), K. pneumoniae 10 (14,92%), P. aeruginosa 3 (4,47%) e A. baumannii 1 (1,49%). Dentre as cepas de Escherichia Coli, 100% foram resistentes a aztreonam, 40% a ampicilina, 30% a piperacilina, 20% a ciprofloxacina e 10% a gentamicina. Nenhuma das cepas bacterianas produziu ESBL ou carbapenems. Dentre as cepas de P. aeruginosa, 100% foram resistentes a ampicilina-sulbactam, enquanto 100% mostraram resistência média a gentamicina. As cepas de K. pneumoniae foram resistentes a ampicilina (70%) e piperacilina (20%); adicionalmente, 50% mostraram resistência média a piperacilina. Não houve casos de resistência total em alguns dos isolados de A. baumannii, que tiveram resistência média a aztreonam eceftriaxona. De modo geral, as taxas de resistência foram baixas nos isolados de P. aeruginosa, Escherichia Coli, K. pneumoniae e A. baumannii.

Pathogenic and opportunistic respiratory bacteria-induced apoptosis

Several pathogenic or opportunistic bacteria have the ability to either induce or inhibit host cell apoptosis. The capacity to modulate cell pathways that result in the induction or delay of host cell apoptosis is considered to be an important bacterial virulence mechanism. These processes could be mediated by different host cell signaling pathways that are subverted by the bacteria. Pathogens are able to activate apoptotic proteins, such as caspases, or inactivate anti-apoptotic proteins, such as NFkB and the MAPKKs, or even up-regulate the endogenous receptor/ligand system that induces apoptosis, generally when the bacteria are bound to the host cell surface. The bacteria-induced apoptotic or anti-apoptotic processes are often related with the fact that the bacteria acquire the ability to reach the host tissues. However, apoptosis is also considered to be a host defense mechanism against infectious agents. Thus, the apoptosis phenomenon plays a central role in host-pathogen interactions.

Evaluación de las enfermedades infecciosas en la Unidad de Cuidados Intensivos Pediátricos durante el 2007 / Evaluation of infectious diseases in the Paediatric Intensive Care Unit during 2007

Se realizó un estudio observacional descriptivo retrospectivo para caracterizar el comportamiento de las infecciones hospitalarias en la Unidad de cuidados intensivos Pediátrico del Hospital Capitán Roberto Rodríguez Fernández durante el período comprendido desde Enero hasta Diciembre de 2007. De los 117 pacientes estudiados el mayor número de enfermedades infecciosas se presentó en los lactantes (31.6 por ciento), el Estafilococo aureus fue el germen que se aisló con mayor frecuencia, siendo las infecciones respiratorias altas y las enfermedades diarreicas agudas, las principales causas de morbilidad; los microorganismos Gram Negativos prevalecieron con respecto a los Gram Positivos y las infecciones intrahospitalarias se presentaron en el 11.9 por ciento de los pacientes; la evolución clínica fue desde estados graves, críticos hasta fallecidos, representando las infecciones hospitalarias el 75.5 por ciento de los niños fallecidos.

The paediatric intensive care unit is the hospital service devoted to the purely overall assistance to critically sick children. A retrospective observational descriptive study was carried out in order to characterize the behaviour of hospital infections in the paediatric intensive care service of the Hospital: Capitán “Roberto Rodríguez Fernández” during the period January – December, 2007. From the 117 patients who were studied, unweaned babies had the greatest number of infectious diseases (31.6 percent). The Staphylococcus Aureus was the germ more frequently isolated, while upper respiratory infections and acute diarrheic diseases were the main morbidity causes. The microorganisms Gram- Negative prevailed over the Gram Positive ones; the 11.9 percent percent of patients suffered from hospital-acquired staph infections. The clinical evolution was from serious condition and critical health condition to deceases, being the hospital-acquired staph infections the cause for the 75, 5 percent of the deceased children.

Colonización bacteriana post mórtem del líquido cefalorraquídeo: Hospital de San José octubre 2007-octubre 2008 / Bacterial colonization in postmortem-collected cerebrospinal fluid: San José Hospital october 2007-october 2008

Como es un imperativo del Hospital de San José determinar el microorganismo responsable de neuroinfección al momento de la autopsia, es necesario realizar investigaciones que determinen la prevalencia y la frecuencia de la colonización bacteriana; así mismo, es importante identificar los gérmenes bacterianos Gram positivos y negativos en los pacientes fallecidos en la institución. Se realizó este estudio de corte transversal en pacientes hospitalizados mayores de 18 años que fallecieron en el Hospital de San José entre el primero de octubre de 2007 y el primero de octubre de 2008, que cumplieran los criterios de inclusión y exclusión. Se realizó punción transcisternal y toma de muestra de líquido cefalorraquídeo previa autorización de los familiares y se procesó el cultivo estandarizado para gérmenes aerobios Gram positivos y negativos. El estudio fue realizado con 25 pacientes fallecidos en el Hospital de San José, de los cuales el 28% presentaron crecimiento en el cultivo del LCR de muestras aisladas en un tiempo menor de trece horas post mórtem (siete casos).

As identifying the etiologic agent of neurological infection at autopsy is mandatory at the San José Hospital, an investigative procedure to determine the prevalence and frequency of bacterial colonization is required; likewise, it is important to identify gram-positive and gram-negative bacteria in patients who die at the institution. This cross sectional study was conducted in older than 18 year patients who died at said hospital between October 1st, 2007 and October 1st 2008 satisfying the inclusion/ exclusion criteria. After attaining consent from their relatives, a sample of cerebrospinal fluid (CSF) was procured by a Foramen Magnum puncture. Samples were processed using the standard aerobic gram-positive and gram-negative culture techniques. The study was conducted in 25 patients. Growth of bacterial cultures was detected in 28% (7 cases) of the CSF samples isolated at a less than 13-hour post-mortem interval.

Prevalência do staphylococcus aureus resistente à meticilina, isolado em hemoculturas de pacientes internados em alguns hospitais do Distrito Federal, Brasil / Prevalence of meticilin resistent Staphylococcus aureus isolated in blood cultures of hospitalized patients in Some Hospitals at Distrito Federal-Brazil

Introdução. O Staphylococcus aureus resistente à meticilina é um problema identificado nos hospitais e, mais recentemente, na comunidade. Objetivo. Identificar a prevalência de Staphylococcus aureus resistente à meticilina em pacientes internados. Métodos. Foi realizado, no período de janeiro a dezembro de 2006, levantamento de todas as hemoculturas positivas de Staphylococcus aureus de três hospitais públicos (A, B e C) e em três hospitais privados (D, E e F) do Distrito Federal.Resultados. Foram identificadas 265 amostras positivas de S. aureus com prevalência de 47,9%. Dentre os hospitais analisados, encontraram-se 69,1% (97/67) na instituição A; 28,6% (63/18) em B; 73,2% (41/30) em C; 14,8%(27/4) em D; 18,2% (22/4) em E; e 26,7% (15/4) na instituição F.Conclusão. A prevalência global de Staphylococcus aureus resistente à meticilina das instituições avaliadas é elevada e compatível com dados nacionais e internacionais. No entanto, a distribuição foi heterogênea com prevalência maior nas instituições públicas.

Introduction. The meticilin resistent Staphylococcus aureus is a problem identified in hospitals and more recently in the community. Objective. Identify the prevalence of meticilin resistent Staphylococcus aureus in hospitalized patients. Methods. A survey of all Staphylococcus aureus positive blood cultures from January to December 2006 was carried at six hospitals, three public (A, B and C) and three private (D, E e F) institutions at the Distrito Federal. Results. Two hundred and sixty five Staphylococcus aureus positive samples were identified with a prevalence of 47,9% of the meticilin resistent strand. Of all the analyzed hospitals a prevalence of 69.1% (97/67) for the institution A; 28.6% (63/18) for the B; 73.2% (41/30) for the C; 14.8% (27/4) for the D; 18.2% (22/4) for the E; 26.7% (15/4) for the F. Conclusion. The global prevalence of meticilin resistent Staphylococcus aureus at evaluated institutions is high and compatible with national and international data. However the distribution was heterogeneous with a higher prevalence in public institutions.

Calidad microbiológica de la leche humana procesada en el banco de leche materna: Hospital Ruiz y Páez: Ciudad Bolívar / Microbiological quality of human milk proccessed in the human milk bank: Hospital Ruiz y Paéz: City Bolívar

Los Bancos de Leche Humana son centros especializados que garantizan un producto bacteriológicamente seguro a los niños que la reciben. Evaluar la calidad microbiológica de la leche humana procesada en el Banco de Leche del Hospital "Ruiz y Páez", Ciudad Bolívar. Se recolectaron 30 muestras de leche obtenidas por extracción mecánica, durante el período agosto-noviembre del año 2004, se analizaron microbiológicamente antes y después de su pasteurización. Los parámetros investigados fueron recuento de Bacterias Aerobias Mesófilas, Coliformes Totales, Coliformes Fecales, Escherichia coli, y Estafilococos coagulasa positivos. La leche humana sin pasteurizar mostró una carga microbiana total con un máximo de 105 UFC/ml, representado por el recuento de aerobios mesófilos. En cuanto al recuento de estafilococos, en 76.7 por ciento (23 muestras) creció hasta 10 UFC/ml y Staphylococcus aureus, en 16.7 por ciento (5 muestras) se presentó en el orden de 10 UFC/ml. Con relación a los Coliformes Totales, sus recuentos fueron menor o igual 102 NMP/ml, Coliformes Fecales menor a 10NMP/ml, no se encontró Escherichia coli. Luego de efectuar el proceso de pasteurización, se determinó la ausencia de microorganismos en todas las muestras analizadas. La leche humana distribuida a los niños de este hospital se encuentra dentro de los estándares microbiológicos demostrando ser apropiadas las condiciones bajo las cuales se pasteuriza la leche humana en el Banco de leche del Hospital "Ruiz y Páez".

The Human Milk Banks are specialized centers that guarantee a bacteriologicaly safe product for those children who receive it. To evaluate the microbiological quality of processed human milk at the Milk Bank of the Hospital Ruiz y Páez, of Ciudad Bolivar. 30 milk samples were collected by mechanical extraction, during the period of August-November 2004. The samples were microbiologically analyzed before and after its pasteurization. The investigated parameters were counts of Aerobic Bacteria Mesophyla, Total Coliforms, Fecal Coliforms, Escherichia coli, and positive coagulase Staphylococci. Human milk prior pasteurization showed a total microbial load with a maximum of 10º UFC/ml, which was represented by the count of mesophile aerobes. The count of Staphylococci, reached 10 UFC/ml in 76,7 % (23 samples), Staphylococcus aureus was present up to10 UFC/ml in 16,7% (5 samples). In relation with the total Coliforms, their counts were under or equal to 10 NMP/ml and fecal Coliforms under 10 NMP/ml. Escherichia coli was not found. After pasteurization, all samples were free from any type of microorganism. The human milk distributed to children of this hospital, is within microbiological standards, indicating that the conditions under which human milk is pasteurized at the Milk Bank of the Hospital Ruiz and Páez are appropriate.

Characterization and experimental infection of Flexibacter maritimus (Wakabayashi et al. 1986) in hatcheries of post-larvae of Litopenaeus vannamei Boone, 1931

A preliminary study to characterize filamentous bacteria, whose presence is related to high mortality of Litopenaeus vannamei larvae cultured in Santa Catarina State, Brazil, is reported. The extract of infected larvae was diluted in different concentrations, cultured in marine agar (DifcoTM, Marine Agar 2216) and incubated at 30 °C for 48 hours. The biochemical characterization included hydrolytic reactions of starch, gelatin and tyrosine, growth in TCBS agar, growth in 0 and 37‰ salinity, pigment production in tyrosine agar, production of H2S, nitrate reduction, congo red reaction, oxidase and catalase. The isolated bacteria belong to the species Flexibacter maritimus, Gram-negative bacilli of 0.4-0.5 µm width and 15 µm length. Experiments were carried out on pathogenicity of F. maritimus in post-larvae of L. vannamei. Survival and symptoms in L. vannamei post-larvae 24 hours after inoculation with F. maritimus and its growth in marine agar were evaluated. Mortality was detected around 92,5 percent as well as symptoms like melanized lesions in several parts of body, discolouration of gills, bad formation of appendages and of the last abdominal segment, low motility and feeding reduction. The experimental infection results suggested that isolated bacteria of the genus Flexibacter are pathogenic to the shrimp Litopenaeus vannamei post-larvae.

Neste trabalho, relata-se um estudo preliminar para caracterizar bactérias filamentosas associadas a elevadas mortalidades de larvas e pós-larvas cultivadas no Estado de Santa Catarina, Brasil. Um extrato de larvas infectadas foi diluído em diferentes concentrações, cultivado em Agar Marine (DifcoTM, Marine Agar 2216) e incubado a 30° C por 48 horas. A caracterização bioquímica inclui reações de amido, gelatina e tirosesine, crescimento em Agar TCBS,crescimento a 0 e 37‰ de salinidade, produção de pigmentos em Agar Tirosine, produção de H2S, redução de nitrato, reação vermelho congo, oxidase e catalase. A bactéria isolada apresentou características de Flexibacter maritimus, um bacilo Gram negativo de 0,4-0,5 µm de largura e 15 µm de comprimento. Os experimentos foram realizados sobre a patogenicidade de F. Maritimus, em pós-larvas de L. vannamei. Foram avaliados a sobrevivência e os sintomas das pós-larvas 24 horas após a inoculação com F. Maritimus, além do seu crescimento em Agar Marine. Foram encontradas mortalidades de 92,5 por cento e sintomas próprios da enfermidade, tais como lesões melanizadas em várias partes do corpo, descoloração das brânquias e diminuição da motilidade e da alimentação. Com base nos resultados da infecção experimental, pode se concluir que a bactéria isolada do gênero Flexibacter é patogênica para pós-larvas de L. vannamei.

16s-23S rDNA: polymorphisms and their use for detection and identification of Xylella fastidiosa strains

Strains of Xylella fastidiosa from several hosts (coffee, citrus, grape, almond, oleander, peach, plum, etc.) were characterized by analyzing the content of the nucleotide sequences of 16S-23S rDNA (coding for a small subunit ribosomal RNA) spacer region (ITS). Current methods for sequencing the ITS region yields partial sequences that do not contribute with significant information. According to this fact, new primers have been designed in order to obtain a complete sequence and facilitate the sequencing. The complete 16S-23S sequences from 08 strains were amplified through PCR using the primers designed in our lab. The 16S-23S sequences obtained were compared with 52 others sequences entries in GenBank database. The results revealed a higher level of variation than that found in 16S gene sequences, with similarity values ranging from 0.79-1.00. The dendogram based on similarity data revealed 5 main groups. This spacer sequence contains two genes for tRNA (tRNAala and tRNAile). The sequence analysis of the tRNA content showed a conserved region with a few differences in the nucleotide composition.

Linhagens de Xylella fastidiosa de diferentes hospedeiros (café, uva, amêndoa, ameixa, etc.) foram caracterizados analisando as sequências de nucleotídeos do espaço intergênico 16S-23S (ITS). Os métodos atuais para o sequenciamento da região ITS produzem fragmentos parciais das sequências que não contribuem com informações significantes. Em vista disso, novos primers foram desenhados a fim de obter uma sequência completa e facilitar o sequenciamento. A sequencia completa da região ITS de 08 linhagens de X. Fastidiosa foram amplificadas via PCR, sequenciadas e comparadas com outras 52 sequencias depositadas no GenBank. Os resultados revelaram um alto nível de variação sendo maior que os níveis encontrados quando se utiliza o gene 16S para este tipo de análise, com valores variando entre 0.79 a 1.00. O dendograma baseado em dados de similaridade agrupou as linhagens de X. fastidiosa em 5 grupos principais. Duas sequencias codificadoras de tRNA's foram encontradas (tRNAala e tRNAile) e mostram-se conservadas entre as linhagens analisadas com pouca diferença entre a composição nucleotídica.

Infecciones respiratorias agudas en el lactante: diagnóstico etiológico desde la perspectiva clínica / Acute respiratory infection in infant: etiological diagnosis from the clinical perspective

La mejoría en la identificación etiológica de las infecciones respiratorias agudas bajas se debe a la incorporación rutinaria de métodos inmunológicos de diagnóstico rápido. El rendimiento se relaciona con la selección apropiada del paciente de acuerdo al cuadro clínico y la oportunidad de la solicitud, fundamentalmente en el caso de los virus respiratorios. La interpretación de aquellos casos en que las técnicas diagnósticas disponibles no permiten la demostración etiológica requiere considerar agentes microbiológicos de descripción reciente.

Associação entre microorganismos salivares e atividade de cárie e gengivite em crianças / Association between salivary microrganisms and caries activity and gengivitis in children

O objetivo foi relacionar a infecção salivar por bactérias Gram-positivas e Gram-negativas com a atividade de cárie e a condição gengival em 29 crianças, de 3 a 12 anos de idade. A amostra foi dividida em dois grupos distintos quanto a presença (G1) ou à ausência (G2) de cavidades cariosas. Realizou-se o teste salivar Nocaries®, e a condição gengival e o índice de cárie foram avaliados. Não houve associação entre infecção salivar por bactérias Gram(-) e doença gengival. No G1, foi observada relação entre a presença de infecção salivar por bactérias Gram (+) e atividade de cárie.

Consideraciones clínico-epidemiológicas en relación a la etiología de las endocarditis infecciosas / Clinic-epidemiologycal considerations related with the infectious endocarditis etiology

La endocarditis infecciosa (EI) persiste como patología frecuente y trascendente. Ha cambiado en relación a la endocarditis subaguda tradicional de antaño: otros tipos de huéspedes, otros factores de riesgo y patologías subyacentes y modificaciones en la distribución etiológica y resistencia de sus agentes causales. Siguen predominando largamente los agentes bacterianos clásicos, aunque se están reconociendo agentes atípicos dados los progresos del diagnóstico microbiológico, serológico y molecular. Desde un punto de vista práctico es útil diferenciar 4 tipos de endocarditis, con distintas manifestaciones, criterios diagnósticos comunes y, en particular, diferente distribución etiológica, que ayuda a buscar con dedicación preferencial los agentes más característicos o, en caso de fallar en el diagnóstico etiológico orientar y dirigir la terapia empírica. Se distingue la clásica EI de paciente valvulópata previo de adquisición extrahospitalaria en donde predomina Streptococcus spp largamente seguido de S aureus y Enterococcus sp. Está luego la EI del paciente con drogadicción endovenosa, excepcional en Chile, cuya etiología mayoritaria es S aureus y en menos grado bacilos Gram negativos (BGN) y menos aún hongos. EI en valvula protésica con etiología variable de acuerdo al momento de ocurrencia, primando S aureus, S coagulasa negativo (SCN), BGN y hongo en la fase precoz, y una distribución más clásica en los casos tardíos sin nunca perder importancia S aureus y SCN. Finalmente están las EI nosocomiales de pacientes con múltiples patologías de base, no siempre cardíacas que hacen EI como consecuencia de bacteremias nosocomiales cuya etiología representa la distribución de éstas, pero predominando S aureus, SCN y BGN.